More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4377 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 378 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  69.77 
 
 		 388 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  65.5 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4209  peptidase M48, Ste24p  65.15 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  66.94 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  64.88 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  66.67 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  45.21 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 		 307 aa  209  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  38.52 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 		 397 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  31.49 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  32.6 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  35.5 
 
 		 299 aa  157  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  33.54 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 		 279 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.21 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  38.21 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  36.57 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  31.66 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  35.02 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  33.12 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  29.6 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  31.75 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  31.56 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  33.47 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  36.09 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  35.74 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  33.85 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  36.21 
 
 		 294 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  35.16 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  34.26 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  33.67 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  34.47 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  32.36 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  35.07 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  32.69 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  32.92 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  33.22 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.59 
 
 		 307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  35.37 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  36.15 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  38.19 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  34.12 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  33.07 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  35.98 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  34 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  34.92 
 
 		 279 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  34.12 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  34.26 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  38.43 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  32.27 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  38.76 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  32.41 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  33.6 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  33.71 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  34.98 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  37.7 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  36.99 
 
 		 290 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  33.78 
 
 		 307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  35.69 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  35.6 
 
 		 292 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  34.25 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 		 280 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  28.11 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.2 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  31.87 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.6 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  31.87 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.87 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  33.99 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  31.68 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  32.23 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  32.11 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  33.2 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  34.27 
 
 		 279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  30.28 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.62 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  35.12 
 
 		 307 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  30.28 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  34.73 
 
 		 289 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 308 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  33.47 
 
 		 286 aa  126  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.62 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.62 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>