More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3151 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1367    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000295  Zn-dependent protease with chaperone function  39.5 
 
 		 629 aa  399  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000240475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1831  peptidase M48, Ste24p  36.3 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1739  peptidase M48 Ste24p  37.57 
 
 		 661 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  37.7 
 
 		 661 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  36.01 
 
 		 659 aa  351  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 		 657 aa  349  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  37.67 
 
 		 654 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 		 672 aa  340  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 		 613 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5171  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 		 658 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 		 673 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 673 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3305  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 		 663 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  47.93 
 
 		 631 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3637  peptidase M48, Ste24p  35.92 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.086452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4439  peptidase M48, Ste24p  37.46 
 
 		 335 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  37.88 
 
 		 319 aa  154  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  35.58 
 
 		 299 aa  147  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  33.58 
 
 		 304 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  32.45 
 
 		 396 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 397 aa  137  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  32.58 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  32.84 
 
 		 299 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 		 297 aa  131  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  32.58 
 
 		 296 aa  130  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  30.82 
 
 		 294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  34.84 
 
 		 298 aa  128  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 		 282 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  35.32 
 
 		 330 aa  124  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 		 274 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  32.2 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  32.2 
 
 		 339 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 		 285 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 286 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 		 378 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 285 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  33.48 
 
 		 283 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 		 396 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  32.88 
 
 		 295 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  32.33 
 
 		 280 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  28.36 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 		 283 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  32.76 
 
 		 280 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  32.42 
 
 		 285 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  32.11 
 
 		 286 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  29.28 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 283 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.02 
 
 		 286 aa  109  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  33.2 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  28.98 
 
 		 291 aa  108  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 		 292 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  29.71 
 
 		 294 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  27.36 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 288 aa  107  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  29.54 
 
 		 296 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  30.32 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  25.53 
 
 		 383 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  29.41 
 
 		 291 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  31.6 
 
 		 290 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  29.41 
 
 		 291 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  32.42 
 
 		 285 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  29.41 
 
 		 291 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  32.03 
 
 		 305 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  29.31 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  31.3 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  31.67 
 
 		 287 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  29.44 
 
 		 292 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 308 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  33.07 
 
 		 293 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  30.15 
 
 		 320 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  31.89 
 
 		 294 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  30.27 
 
 		 339 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  30.91 
 
 		 291 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2120  heat shock protein HtpX  32.27 
 
 		 292 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000401821  hitchhiker  0.0000953283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 287 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  33.07 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  29.26 
 
 		 318 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  28.52 
 
 		 304 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  32.67 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  33.48 
 
 		 287 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 		 294 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>