More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4439 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4439  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
335 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3637  peptidase M48, Ste24p  77.58 
 
 
339 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.086452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  41.85 
 
 
672 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  38.9 
 
 
655 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  41.72 
 
 
657 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000295  Zn-dependent protease with chaperone function  37.39 
 
 
629 aa  192  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000240475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  38.04 
 
 
664 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  37.9 
 
 
659 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1739  peptidase M48 Ste24p  39.49 
 
 
661 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5171  peptidase M48 Ste24p  38.25 
 
 
658 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  41.77 
 
 
654 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  38.59 
 
 
613 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  41.07 
 
 
661 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  42.91 
 
 
673 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1831  peptidase M48, Ste24p  35.31 
 
 
670 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  45.85 
 
 
631 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  44 
 
 
673 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3305  peptidase M48, Ste24p  42.29 
 
 
663 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  32.71 
 
 
304 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  35.56 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  33.84 
 
 
396 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  31.37 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  30.9 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
285 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
292 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 
299 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  32.76 
 
 
282 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  34.91 
 
 
299 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  29.08 
 
 
330 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  27.16 
 
 
296 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  31.62 
 
 
279 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  29.5 
 
 
298 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  30.84 
 
 
280 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  34.71 
 
 
290 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  32.48 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  32.74 
 
 
291 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  25.63 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  36.16 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  31.23 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  30.37 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  34.82 
 
 
300 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  34.82 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  29.51 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  31 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.49 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
306 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  29.5 
 
 
296 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1517  heat shock protein HtpX  31.56 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0660  heat shock protein HtpX  31.56 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  31.72 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  28.88 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  32.1 
 
 
280 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  31.7 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  30.7 
 
 
294 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.73 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1436  peptidase M48, Ste24p  29.91 
 
 
977 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.994868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  32.52 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  33.02 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  31.97 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  31.3 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  30.49 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.78 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 
294 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  32.71 
 
 
324 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  29.87 
 
 
318 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  30.04 
 
 
285 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  32.29 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  32.24 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  28.23 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.93 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  30.84 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  30.48 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  30.43 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  31.78 
 
 
285 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  28.63 
 
 
279 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 
283 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  31.78 
 
 
285 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.78 
 
 
285 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  31.21 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  31.78 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  31.78 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  31.21 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  31.13 
 
 
315 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  31.78 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  28.2 
 
 
280 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
296 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  30.37 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  30.88 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>