More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000295 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000295  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 		 629 aa  1291    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000240475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  39.64 
 
 		 664 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  38.73 
 
 		 655 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  36.28 
 
 		 659 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 		 657 aa  336  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  37.28 
 
 		 613 aa  333  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1831  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 		 670 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  35.32 
 
 		 672 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1739  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 		 661 aa  293  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 661 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5171  peptidase M48 Ste24p  35.07 
 
 		 658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  35.18 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 		 673 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  49.64 
 
 		 631 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3305  peptidase M48, Ste24p  47.08 
 
 		 663 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3637  peptidase M48, Ste24p  37.01 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.086452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4439  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 		 335 aa  184  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  41.03 
 
 		 319 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  38.33 
 
 		 304 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 330 aa  142  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  38.94 
 
 		 299 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  33.33 
 
 		 396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  33 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  30.43 
 
 		 296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  32.12 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 		 282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 		 307 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  34.65 
 
 		 298 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  34.08 
 
 		 297 aa  117  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 		 306 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  31.55 
 
 		 291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  30.04 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  27.55 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  30.04 
 
 		 339 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  33.63 
 
 		 274 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 		 285 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  29.57 
 
 		 296 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  29 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  29.63 
 
 		 291 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  33.62 
 
 		 292 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  31.8 
 
 		 286 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  29.97 
 
 		 292 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 		 396 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  31.09 
 
 		 279 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1916  heat shock protein HtpX  33.2 
 
 		 288 aa  107  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  32.43 
 
 		 285 aa  107  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  33.04 
 
 		 294 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  30.77 
 
 		 283 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  32.59 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  28.33 
 
 		 296 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  29.3 
 
 		 283 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  31.74 
 
 		 281 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  29.33 
 
 		 318 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  30.36 
 
 		 279 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  28.66 
 
 		 293 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  34.47 
 
 		 287 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2748  heat shock protein HtpX  34.04 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.459812  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.75 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  32.92 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  31.86 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3142  heat shock protein HtpX  28.18 
 
 		 300 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.8089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0635  heat shock protein HtpX  33.89 
 
 		 287 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000279457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1034  heat shock protein HtpX  31.97 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 		 285 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  32.89 
 
 		 304 aa  101  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2175  heat shock protein HtpX  29.65 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000524966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 295 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  30.8 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 283 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  29.43 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1883  heat shock protein HtpX  29.02 
 
 		 293 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000193864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.7 
 
 		 285 aa  101  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  31.39 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4018  heat shock protein HtpX  29.02 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000275488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4316  heat shock protein HtpX  29.02 
 
 		 291 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 285 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.7 
 
 		 285 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 296 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  32.74 
 
 		 305 aa  100  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  31.96 
 
 		 339 aa  100  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 285 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0293  heat shock protein HtpX  33.61 
 
 		 292 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.985067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  31.11 
 
 		 290 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 285 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 285 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.67 
 
 		 283 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>