More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3637 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3637  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
339 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.086452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4439  peptidase M48, Ste24p  77.58 
 
 
335 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  40.48 
 
 
672 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  38.75 
 
 
655 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  39.58 
 
 
657 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  36.19 
 
 
664 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000295  Zn-dependent protease with chaperone function  37.46 
 
 
629 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000240475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1739  peptidase M48 Ste24p  37.57 
 
 
661 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  37.18 
 
 
659 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5171  peptidase M48 Ste24p  39.76 
 
 
658 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  41 
 
 
654 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  38.23 
 
 
661 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 
613 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  43.11 
 
 
673 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  45.06 
 
 
673 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1831  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 
670 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3305  peptidase M48, Ste24p  42.76 
 
 
663 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  41.91 
 
 
631 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  30.74 
 
 
304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  35.66 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  27.91 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.49 
 
 
285 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 
397 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  27.24 
 
 
299 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  27.66 
 
 
296 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  34.48 
 
 
291 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  27.93 
 
 
397 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  27.86 
 
 
297 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  27.99 
 
 
282 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  28.01 
 
 
396 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  26.69 
 
 
330 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 
285 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0660  heat shock protein HtpX  32.93 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1517  heat shock protein HtpX  32.93 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  29.7 
 
 
299 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  28.32 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  32.77 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  30.59 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  26.65 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  30.55 
 
 
280 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 
295 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  29.96 
 
 
296 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  31.06 
 
 
289 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.98 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  30.83 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  29.96 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  33.19 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
286 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  30.23 
 
 
280 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  33.06 
 
 
290 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 
296 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1436  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
977 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.994868  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  34.36 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  29.32 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1778  heat shock protein HtpX  29.76 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3616  heat shock protein HtpX  29.76 
 
 
295 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 
283 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  31.44 
 
 
285 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  30.68 
 
 
285 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  29.36 
 
 
280 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3984  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
295 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  30.04 
 
 
285 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  29.69 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 
274 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  25.74 
 
 
396 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  29.69 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  29.69 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  29.2 
 
 
288 aa  86.3  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  29.32 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  33.48 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  29.87 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  30.49 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  32.19 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  31.06 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  28.57 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  30.14 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  31.06 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.06 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  28.13 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  30.13 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  29.6 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  28.36 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  29.63 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3844  heat shock protein HtpX  31.39 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00537908  normal  0.388849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>