163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5738 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  38.31 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  34.43 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  35.83 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  34.27 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  32.38 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  33.46 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  33.87 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  34.05 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  34.05 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  32.36 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  33.06 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  33.06 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  45.87 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  33.48 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  47.87 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 		 407 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  33.07 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  35.93 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  37.72 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  38.17 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  36.07 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  33.66 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  41.77 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  34.35 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  32.49 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  40.87 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  42.2 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  36.31 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  32.86 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  32.63 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  36.61 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  31.17 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  36.72 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  35.12 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  38.57 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  40.2 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  47.89 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  31.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  27.13 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  30.56 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  37.97 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  37.97 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  39.24 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  38.2 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  26.37 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  26.7 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  35.87 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  45.07 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  43.66 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  43.66 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  34.78 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  29.85 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  40 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  34.78 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  31.48 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  37.97 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  38.75 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  36.36 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  32.98 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  37.97 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  40 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  38.64 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  37.63 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  36.71 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  40.58 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  39.24 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  35.38 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  34.26 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  40 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  36.71 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  34.62 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  29.14 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  39.24 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  29.63 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>