65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11873 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  591  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  75.55 
 
 
311 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  73.33 
 
 
316 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  73.33 
 
 
316 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  73.33 
 
 
316 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  73.75 
 
 
311 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  59.42 
 
 
316 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  62.33 
 
 
313 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  48.17 
 
 
313 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  38.94 
 
 
314 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  38.19 
 
 
315 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.94 
 
 
407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  39.11 
 
 
316 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  37.86 
 
 
315 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  37.79 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  41.1 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  37.9 
 
 
431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  38.46 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 
334 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  45.95 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  35.83 
 
 
301 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  41.38 
 
 
301 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  35.09 
 
 
308 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  41.36 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  36.7 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  33.58 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 
338 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  32.86 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
382 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  43.41 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  39.22 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  34.85 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  35.79 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  34.85 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  38.55 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  35.86 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  36.36 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  36.36 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  36.43 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  38.18 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  38.18 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  36.62 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  53.06 
 
 
383 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  39.5 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  41.11 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  24.12 
 
 
326 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  38.18 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  29.09 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  34.38 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>