80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1620 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
334 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  83.04 
 
 
330 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  44.15 
 
 
314 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  41.37 
 
 
315 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  31.77 
 
 
407 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  38.73 
 
 
314 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  37.74 
 
 
308 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  37.98 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  39.02 
 
 
314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  50.46 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
431 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  36.96 
 
 
316 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  33.9 
 
 
297 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  37.89 
 
 
301 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  38.69 
 
 
301 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  32.02 
 
 
316 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  34.24 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  37.1 
 
 
301 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  35.11 
 
 
315 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
311 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
338 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  34.1 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  35.12 
 
 
311 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
382 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  32.49 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  37.64 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  36 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  38.24 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  40 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  40 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  40 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  36.44 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  38.71 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  40.82 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  40.82 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  36.15 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  39.62 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  36.26 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  36.46 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  32.08 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  35.42 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  24.35 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
270 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  30.64 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  38.64 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0932  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.282641  normal  0.192272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  28.18 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.56 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  27.84 
 
 
282 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2852  peptidase M48, Ste24p  41.54 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  25.33 
 
 
270 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  25.33 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  25.33 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  25.33 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1624  peptidase M48, Ste24p  32.99 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00256903  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  43.28 
 
 
284 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  41.94 
 
 
383 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  26.74 
 
 
270 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>