77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4245 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 316 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  98.73 
 
 		 316 aa  591  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  32.07 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  32.07 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  35.34 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  29.08 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  37.85 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  35.27 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  38.26 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  35.98 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  35.98 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  32.89 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  34.14 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  36.36 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  37.88 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  30.94 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  38.1 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  41.03 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  35.9 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  38.41 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  40.65 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  38.28 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  33.83 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  36.52 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  36.51 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  39.83 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  36.62 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.66 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  34.62 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  42.25 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  32.46 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  38.61 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  39.26 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  29.73 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  29.73 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  49.06 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  41.82 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  38.1 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  34.26 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  28.47 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  44.44 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  43.64 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  50.94 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  34.78 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  38.89 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0932  peptidase M48, Ste24p  36.47 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.282641  normal  0.192272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  43.64 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  43.64 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  41.67 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  32.17 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  41.67 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>