58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0023 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  597  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  37.99 
 
 
309 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  38.52 
 
 
338 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  37.18 
 
 
382 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  40.8 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  34.08 
 
 
315 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  36.73 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  37.8 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  37.15 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  36.93 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  37.98 
 
 
314 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
306 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  37.98 
 
 
314 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  32.86 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  37.01 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  37.2 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  42.41 
 
 
314 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  31.83 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  34.67 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  36.25 
 
 
314 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  37.97 
 
 
307 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  37.97 
 
 
307 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  41.28 
 
 
304 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  46.88 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  46.88 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  46.88 
 
 
316 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
313 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
314 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  38.25 
 
 
306 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  34.04 
 
 
315 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  32.17 
 
 
297 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 
301 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  38.71 
 
 
306 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  38.71 
 
 
306 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 
301 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  43.67 
 
 
301 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  37.14 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  47.93 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 
334 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  42.95 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  33.12 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  38.13 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  35.81 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  39.56 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  40.48 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  25.45 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>