71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
297 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  44.7 
 
 
314 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  43.41 
 
 
308 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  45.67 
 
 
301 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  42.97 
 
 
304 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  43.13 
 
 
301 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  40.59 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  44.76 
 
 
315 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 
301 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  39.03 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  38.01 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  34.19 
 
 
407 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  37.4 
 
 
311 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  48.25 
 
 
431 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  37.79 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  37.12 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  39.06 
 
 
311 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  36.86 
 
 
316 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  36.86 
 
 
316 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  36.86 
 
 
316 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  35.27 
 
 
334 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  32.17 
 
 
316 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  40.8 
 
 
314 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  44.68 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  44.68 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 
330 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  44.76 
 
 
314 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  40.89 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  37 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  43.97 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  45.22 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  37.89 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  37.58 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  35.45 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  37.25 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  37.93 
 
 
308 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  39.39 
 
 
319 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  45.05 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  38.71 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  38.71 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  35.37 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  35.37 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  35.37 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  36.6 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  26.4 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  27.56 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  25.77 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  33.33 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  33.06 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.54 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  23.5 
 
 
326 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 
299 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  34.21 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  34.21 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  30.83 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  35.09 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  33.1 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  37.29 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2852  peptidase M48, Ste24p  36.62 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  25.13 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  36.26 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>