66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5290 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  587  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  94.12 
 
 
306 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  74.18 
 
 
306 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  75.49 
 
 
307 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  75.82 
 
 
307 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  75.82 
 
 
307 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  44.33 
 
 
314 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  43.45 
 
 
314 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  43.48 
 
 
314 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  43.48 
 
 
314 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  45.54 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  44.71 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  42.49 
 
 
308 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  35.02 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  35.22 
 
 
382 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 
338 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  43.88 
 
 
334 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  37.95 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  36.43 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  36.43 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  36.43 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  36.42 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  37.98 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  39.1 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  44.44 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  34.43 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  34.81 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  30.45 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  34.43 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  36.43 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  38.17 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  41.94 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  37.1 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  31.62 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  44.55 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  34.52 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  33.54 
 
 
330 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  31.09 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  34.41 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  34.18 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  37.76 
 
 
383 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  36.56 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  30.93 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  30.16 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
522 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  38.98 
 
 
332 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1994  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>