89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0306 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
314 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  37.34 
 
 
407 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  42.51 
 
 
330 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  44.71 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  44.15 
 
 
334 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
431 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  41.54 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  46.67 
 
 
310 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  44.77 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  36.59 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  39.56 
 
 
304 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  38.06 
 
 
313 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  36.79 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  36.79 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  35.31 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  36.79 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  37.83 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  37.76 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  40.4 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  42.79 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  38.01 
 
 
301 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 
313 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  37.64 
 
 
308 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  38.29 
 
 
314 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  34.31 
 
 
316 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  45.24 
 
 
329 aa  89.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  41.96 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  40.56 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  40.56 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  40.56 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  42.06 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  34.35 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  37.76 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  34.36 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  45.19 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  41.98 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  44.79 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  44.79 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  33.57 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  38.94 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  35.96 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  35.96 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  35.96 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  34.93 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  27.06 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1624  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
295 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00256903  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  34.69 
 
 
330 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  25.6 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  35.75 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  34.01 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  31.14 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  29.53 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  26.92 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  23.65 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  37.33 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  37.5 
 
 
328 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0932  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 
296 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.282641  normal  0.192272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  28.4 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  25.69 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  28.4 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  23.66 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  38.37 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  25.23 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  36.67 
 
 
324 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  36.99 
 
 
416 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  36.84 
 
 
411 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  36.84 
 
 
416 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  24.76 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  32.91 
 
 
417 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>