287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1976 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0932  peptidase M48, Ste24p  66.1 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.282641  normal  0.192272 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  67.01 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1624  peptidase M48, Ste24p  65.65 
 
 
295 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00256903  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  34.66 
 
 
427 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  30.3 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0346  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.667775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  30.87 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  29.23 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  29.23 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  32.21 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  32.88 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  28.28 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  33.51 
 
 
422 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  37.41 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  31.63 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  44.07 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1694  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  44.07 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  29.02 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  28.36 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  28.72 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  51.85 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  46.15 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  46.3 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  27.23 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  29.66 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  48.15 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  42.37 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  28.97 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  37.78 
 
 
453 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  46.3 
 
 
285 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  37.14 
 
 
427 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  29.86 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  44.44 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  44.44 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  29.79 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  32.34 
 
 
675 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  28.57 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  44.07 
 
 
313 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  26.88 
 
 
299 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  30.07 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 
469 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  29.86 
 
 
324 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  34.07 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  26.22 
 
 
415 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  48.15 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  30 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  32.92 
 
 
419 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  30.59 
 
 
428 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  25.7 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.36 
 
 
479 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  25.7 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  30.41 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  25.7 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  32.92 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  40.74 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  26.46 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  51.85 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  46.3 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  27.04 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  38.98 
 
 
342 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  33.1 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  34.59 
 
 
418 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.1 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  23.56 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  27.04 
 
 
288 aa  49.3  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  32.41 
 
 
285 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  48.15 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  44.64 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  32.64 
 
 
417 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  30 
 
 
437 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  35.77 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  45.9 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>