More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0617 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 479 aa  959    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  53.4 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  47.66 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 		 504 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  32.33 
 
 		 493 aa  222  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  32.11 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 		 513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  213  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  31.24 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.26 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  32.44 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  32.19 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 		 487 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  31.56 
 
 		 496 aa  206  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 		 516 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  31.26 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.41 
 
 		 489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.11 
 
 		 489 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  37.2 
 
 		 489 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  38.23 
 
 		 490 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  29 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  29.05 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.53 
 
 		 479 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.6 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  38.36 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.49 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25.7 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  37.96 
 
 		 436 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  38.03 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  36.44 
 
 		 423 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  36.57 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  38.97 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  37.95 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  38.25 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 284 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.98 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  37.68 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  32.89 
 
 		 285 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  32.39 
 
 		 288 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  37.1 
 
 		 312 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  38.19 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 		 247 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 262 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 		 280 aa  106  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  35.12 
 
 		 278 aa  106  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  33.01 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 		 365 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  35.6 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  35 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  37.77 
 
 		 270 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  33.64 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 		 289 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  37.17 
 
 		 307 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  35.83 
 
 		 294 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  31.31 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 278 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  34.33 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 		 268 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  34.33 
 
 		 477 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  36.27 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  30.36 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  30.33 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  33.63 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  35.96 
 
 		 590 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 		 569 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  36.27 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  33.8 
 
 		 255 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 		 248 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>