More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1307 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  994    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  43.99 
 
 
513 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  38.19 
 
 
478 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  37.33 
 
 
479 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  36.59 
 
 
479 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 
504 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36.53 
 
 
489 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
492 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  37.82 
 
 
489 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.3 
 
 
489 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  40.3 
 
 
489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 
503 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
513 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 
513 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
494 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
493 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 
503 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  31.93 
 
 
482 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 
516 aa  182  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.56 
 
 
493 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 
496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 
497 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 
478 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 
493 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.43 
 
 
475 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  29.18 
 
 
520 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.57 
 
 
494 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 
505 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  37.97 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  29.54 
 
 
513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  30.79 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 
476 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.62 
 
 
488 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  37.59 
 
 
445 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
497 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
524 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  36.23 
 
 
424 aa  163  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  27.53 
 
 
471 aa  162  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  33.01 
 
 
514 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  34.95 
 
 
442 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  35.96 
 
 
427 aa  146  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.62 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 
423 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  37.14 
 
 
436 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 
266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  35.04 
 
 
278 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 
268 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.55 
 
 
268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
443 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
445 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.68 
 
 
264 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.6 
 
 
272 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 
266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 
270 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
500 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 
266 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.89 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
278 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  33.78 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 
248 aa  118  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 
280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 
284 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.04 
 
 
269 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
292 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.3 
 
 
294 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.12 
 
 
262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  36.13 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.98 
 
 
269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 
284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
470 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
279 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
279 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
474 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 
269 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 
269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 
269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
480 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  36.41 
 
 
365 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  29.04 
 
 
267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.21 
 
 
263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
269 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
269 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
278 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  29.15 
 
 
266 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  29.11 
 
 
481 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
269 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 
269 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  26.59 
 
 
477 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  32.79 
 
 
284 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>