More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3171 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
445 aa  914    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  54.25 
 
 
447 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  52.06 
 
 
443 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  43.51 
 
 
442 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  44.23 
 
 
453 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  46.4 
 
 
445 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  37.21 
 
 
474 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  38.64 
 
 
427 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.54 
 
 
436 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
424 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  37.74 
 
 
490 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  39.42 
 
 
492 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 
423 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  40.07 
 
 
529 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 
432 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  39.3 
 
 
489 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  38.03 
 
 
489 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.11 
 
 
513 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  35.18 
 
 
478 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  39.35 
 
 
489 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.66 
 
 
504 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  39.35 
 
 
489 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.98 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  34.98 
 
 
479 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
494 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
268 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
268 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.88 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
284 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 
278 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 
266 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  36.63 
 
 
282 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.41 
 
 
264 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
280 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 
632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  34.94 
 
 
481 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  33.76 
 
 
490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.6 
 
 
285 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 
632 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.36 
 
 
278 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 
270 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
278 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  30.96 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.84 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.84 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 
493 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.16 
 
 
294 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  31.91 
 
 
275 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
266 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.78 
 
 
528 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 
604 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  32.51 
 
 
263 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
340 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 
474 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 
320 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6469  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 
573 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.92 
 
 
262 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
475 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
247 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 
487 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 
550 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  29.96 
 
 
265 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.62 
 
 
312 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  30.49 
 
 
262 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  32.78 
 
 
267 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
472 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 
292 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 
480 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  31.44 
 
 
469 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 
268 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 
488 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 
605 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 
487 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
271 aa  100  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
292 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 
640 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  28.67 
 
 
513 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  30.21 
 
 
494 aa  99.8  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 
482 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  30.21 
 
 
494 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.53 
 
 
266 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 
265 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  28.51 
 
 
493 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  33.06 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 
262 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.71 
 
 
272 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  29.03 
 
 
475 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  25.64 
 
 
480 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 
248 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>