More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3812 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  79.51 
 
 
503 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  98.34 
 
 
482 aa  968    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  80.42 
 
 
513 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
513 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  60.86 
 
 
493 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  61.64 
 
 
475 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  61.22 
 
 
476 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  56.76 
 
 
480 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  45.57 
 
 
471 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  42.44 
 
 
520 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  41.77 
 
 
488 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  42.47 
 
 
496 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  41.78 
 
 
503 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  44.37 
 
 
497 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  40.66 
 
 
497 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  43.38 
 
 
497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  42.69 
 
 
505 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  41.69 
 
 
478 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  42.49 
 
 
500 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  42.49 
 
 
487 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 
504 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  38.49 
 
 
516 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  40.09 
 
 
514 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 
493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  41.01 
 
 
494 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  40.89 
 
 
524 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
513 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.57 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.26 
 
 
490 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  28.88 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  30.5 
 
 
479 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  30.18 
 
 
479 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.76 
 
 
489 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.4 
 
 
489 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  26.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
492 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  34.2 
 
 
489 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.1 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  24.4 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
494 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 
427 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  28.62 
 
 
554 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 
269 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 
484 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 
278 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 
266 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 
269 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  28.28 
 
 
568 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 
269 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.34 
 
 
266 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
269 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
269 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
269 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 
269 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
269 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  32.28 
 
 
477 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  32.35 
 
 
436 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.67 
 
 
445 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.48 
 
 
262 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 
424 aa  97.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  32.12 
 
 
255 aa  97.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  33.88 
 
 
480 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
268 aa  96.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  31.1 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.38 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 
280 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 
293 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  34.55 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
286 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  32.23 
 
 
259 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 
282 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
266 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
262 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
270 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
566 aa  94  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 
263 aa  94  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.63 
 
 
269 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 
268 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.37 
 
 
272 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  30.37 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 
278 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 
266 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 
248 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 
445 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 
320 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  31.28 
 
 
263 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.11 
 
 
264 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.35 
 
 
265 aa  90.9  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
284 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  27.05 
 
 
278 aa  90.1  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.78 
 
 
285 aa  90.1  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  31.8 
 
 
478 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  29.81 
 
 
288 aa  89.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  31.22 
 
 
231 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 
489 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 
489 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>