More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7542 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  77.26 
 
 
505 aa  737    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1003    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  77.94 
 
 
496 aa  766    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  77.43 
 
 
497 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  79.08 
 
 
503 aa  794    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  78.26 
 
 
497 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  79.23 
 
 
497 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  55 
 
 
520 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  43.06 
 
 
493 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  43.28 
 
 
475 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  42.53 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  42.26 
 
 
493 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  41.93 
 
 
516 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  41.92 
 
 
503 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  42.56 
 
 
480 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  41.56 
 
 
482 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  41.87 
 
 
524 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
478 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  41.77 
 
 
513 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  42.64 
 
 
487 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  42.42 
 
 
500 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  41.82 
 
 
513 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  39.67 
 
 
514 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  41.88 
 
 
494 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  41.58 
 
 
504 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  38.3 
 
 
471 aa  326  7e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.16 
 
 
479 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
493 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
513 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  35.69 
 
 
489 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 
489 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  28.16 
 
 
490 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 
489 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  27.74 
 
 
479 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  26.4 
 
 
479 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  27.94 
 
 
478 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  25.89 
 
 
492 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.57 
 
 
513 aa  148  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.99 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 
494 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 
289 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
484 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 
289 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.5 
 
 
280 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 
289 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  31.62 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.31 
 
 
264 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 
427 aa  97.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 
278 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 
286 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  30.87 
 
 
554 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.83 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.9 
 
 
262 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
269 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  29.64 
 
 
502 aa  94.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  33.16 
 
 
366 aa  94.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 
268 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 
424 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.98 
 
 
269 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
284 aa  93.2  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 
268 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  30.43 
 
 
568 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 
269 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 
269 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
486 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.4 
 
 
262 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.19 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 
268 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
529 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
269 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
269 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
269 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  27.57 
 
 
436 aa  90.1  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31 
 
 
266 aa  90.1  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  26.02 
 
 
266 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  26.97 
 
 
267 aa  89.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.35 
 
 
266 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  33.66 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 
278 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
533 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
248 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
269 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.16 
 
 
480 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
282 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 
500 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
490 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30.19 
 
 
288 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 
268 aa  87.8  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 
392 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 
488 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  33.71 
 
 
315 aa  87.4  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 
442 aa  87.4  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.02 
 
 
573 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  27.97 
 
 
477 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.5 
 
 
294 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 
268 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  27.33 
 
 
477 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>