More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2381 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
307 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  45.06 
 
 
288 aa  208  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  39.92 
 
 
288 aa  192  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.89 
 
 
292 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.7 
 
 
292 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  34.68 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.02 
 
 
275 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  37.17 
 
 
436 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 
424 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
489 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  31.38 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 
478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.38 
 
 
479 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.49 
 
 
489 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 
489 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.13 
 
 
513 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
493 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  29.96 
 
 
493 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.63 
 
 
278 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  33.78 
 
 
315 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 
513 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 
494 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.62 
 
 
285 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  34.63 
 
 
490 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  37.17 
 
 
479 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.7 
 
 
294 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 
282 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.96 
 
 
264 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
480 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
427 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.28 
 
 
479 aa  99.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  34.35 
 
 
474 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.6 
 
 
484 aa  99.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
453 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  29.92 
 
 
340 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  29.01 
 
 
500 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.14 
 
 
475 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
395 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
488 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.89 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.89 
 
 
487 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
476 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.89 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.89 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.89 
 
 
487 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 
504 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 
567 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  29.77 
 
 
573 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 
278 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
268 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.58 
 
 
473 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 
569 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 
351 aa  93.2  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  29.18 
 
 
566 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 
268 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
605 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
487 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.09 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
500 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  30.77 
 
 
477 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 
554 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  29.51 
 
 
365 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  36.76 
 
 
480 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.49 
 
 
604 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  30.77 
 
 
477 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  31.03 
 
 
568 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  27.57 
 
 
487 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  34.36 
 
 
478 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  33.01 
 
 
475 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  33.01 
 
 
493 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
487 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  28.8 
 
 
487 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  28.8 
 
 
487 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  28.8 
 
 
487 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
483 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
487 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.77 
 
 
561 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  27.96 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 
487 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 
445 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>