More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3390 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  92.91 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  56.06 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  58.4 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  40.91 
 
 		 365 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  39.83 
 
 		 392 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  38.1 
 
 		 285 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  39.17 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.67 
 
 		 479 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.69 
 
 		 484 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  37.38 
 
 		 632 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 549 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  35.6 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 494 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  36.89 
 
 		 632 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.85 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  31.38 
 
 		 351 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.02 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.9 
 
 		 436 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 		 478 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.33 
 
 		 479 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.03 
 
 		 474 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 605 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 		 521 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  39.17 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  39.91 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 		 514 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 		 445 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  36.79 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  36.79 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  31.87 
 
 		 484 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  34.08 
 
 		 489 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 		 487 aa  131  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.82 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.66 
 
 		 561 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  34.54 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  37.04 
 
 		 500 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 		 604 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.07 
 
 		 489 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 		 489 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 		 567 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.02 
 
 		 513 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 		 569 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 553 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  30.24 
 
 		 481 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 		 548 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.62 
 
 		 573 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.05 
 
 		 502 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.05 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  33.06 
 
 		 489 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.15 
 
 		 470 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 490 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 489 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.2 
 
 		 423 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  33.62 
 
 		 478 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 		 528 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  32.95 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  31.67 
 
 		 533 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.4 
 
 		 490 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 		 493 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 		 485 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 		 480 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  32.79 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  33.62 
 
 		 478 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 562 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  32.22 
 
 		 479 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 562 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.59 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 554 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  34.11 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  31.05 
 
 		 484 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 		 550 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 489 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 489 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 489 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 489 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 		 492 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  32.54 
 
 		 640 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.63 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>