More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1555 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 481 aa  989    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  65.84 
 
 		 490 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  54.09 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  50.11 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  46.63 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  42.48 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  33.25 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.36 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  40.68 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.38 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  36.36 
 
 		 264 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  25.96 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.41 
 
 		 483 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  38.11 
 
 		 502 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.37 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  28.04 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  29.37 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.37 
 
 		 478 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.37 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  27.16 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  27.36 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 489 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 		 487 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  28.15 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  28.44 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.62 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  27.8 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  25.11 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  27.07 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  26.56 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.5 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  30.55 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  33.6 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  28.28 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  26.29 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  29.38 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  30.7 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  33.59 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.18 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  27.99 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  26.57 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  27.99 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.48 
 
 		 268 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.24 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 		 605 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 		 565 aa  124  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  36.51 
 
 		 518 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  27.39 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  27.4 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  27.4 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  27.4 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.53 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 		 289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  29.37 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.4 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.4 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.88 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  35.07 
 
 		 566 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 280 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  25.94 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  25.94 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  28.46 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  25.97 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.18 
 
 		 477 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.99 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  31.37 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  34.94 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  33.62 
 
 		 568 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 		 490 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>