More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1795 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
513 aa  1028    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  59.84 
 
 
493 aa  568  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  53.76 
 
 
479 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  40.81 
 
 
504 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  34.89 
 
 
503 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  36.58 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  33.6 
 
 
475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  33.27 
 
 
493 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  35.32 
 
 
513 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 
493 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 
476 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  34.65 
 
 
480 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  33.66 
 
 
496 aa  227  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  32.46 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
524 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 
497 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
520 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 
516 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  32.08 
 
 
488 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  32.52 
 
 
505 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 
497 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.76 
 
 
500 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  33.96 
 
 
497 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.61 
 
 
494 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 
514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 
494 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  30.85 
 
 
471 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 
492 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.08 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.69 
 
 
490 aa  191  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.46 
 
 
513 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.56 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.11 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.02 
 
 
478 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.26 
 
 
489 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
489 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  26.65 
 
 
479 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 
493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  42.62 
 
 
436 aa  117  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 
284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  37.06 
 
 
392 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  37.56 
 
 
247 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  36.94 
 
 
480 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.34 
 
 
432 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  34.92 
 
 
423 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  38.67 
 
 
424 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  37.38 
 
 
307 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
280 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 
424 aa  104  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  34.26 
 
 
312 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  37.63 
 
 
292 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  28.37 
 
 
288 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 
427 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
529 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
292 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 
442 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
487 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 
487 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
483 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  34.34 
 
 
365 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
271 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 
268 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.3 
 
 
494 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 
488 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.3 
 
 
494 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.84 
 
 
264 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
286 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 
288 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
445 aa  96.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 
268 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.48 
 
 
265 aa  95.5  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.94 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.41 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  30.49 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.94 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  30.36 
 
 
487 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.36 
 
 
487 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.83 
 
 
289 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  32.65 
 
 
473 aa  94.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.49 
 
 
487 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.33 
 
 
589 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.49 
 
 
487 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.33 
 
 
589 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  31.84 
 
 
590 aa  94.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.49 
 
 
487 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
474 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.19 
 
 
487 aa  93.6  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  30.04 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>