More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3262 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
480 aa  975    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  60.85 
 
 
475 aa  611  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  60.64 
 
 
493 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  59.24 
 
 
476 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  57.47 
 
 
482 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  56.76 
 
 
513 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  55.72 
 
 
503 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  54.18 
 
 
513 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  48.36 
 
 
471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  43.09 
 
 
496 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  43.36 
 
 
497 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  43.81 
 
 
503 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  44.72 
 
 
497 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  42.56 
 
 
488 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  43.99 
 
 
505 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  45.21 
 
 
497 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  40.67 
 
 
520 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  39.18 
 
 
516 aa  346  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  42.03 
 
 
478 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 
504 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  40.65 
 
 
500 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  40.65 
 
 
487 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  38.51 
 
 
493 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  40.09 
 
 
514 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  40.97 
 
 
494 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  39.68 
 
 
524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.22 
 
 
513 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.93 
 
 
490 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
489 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  28.66 
 
 
479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.8 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.68 
 
 
479 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
478 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.97 
 
 
489 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 
493 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25.89 
 
 
479 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
278 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 
484 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.12 
 
 
436 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 
289 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 
279 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 
279 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  33.73 
 
 
255 aa  97.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 
268 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
268 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
269 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.01 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
554 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
269 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  32.44 
 
 
259 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 
269 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 
268 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 
266 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.61 
 
 
266 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
269 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.67 
 
 
264 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
269 aa  93.6  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  30.83 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
269 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
566 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
269 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
284 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
269 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  29.23 
 
 
292 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 
266 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.14 
 
 
392 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  36.76 
 
 
307 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  32.56 
 
 
568 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  36.9 
 
 
282 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 
529 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.79 
 
 
285 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 
289 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 
292 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30.87 
 
 
284 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.63 
 
 
269 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
272 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.15 
 
 
280 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 
268 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
289 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  29.3 
 
 
288 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
248 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  32.07 
 
 
561 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.34 
 
 
294 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30.18 
 
 
477 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
453 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  33.8 
 
 
275 aa  87.4  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  30.96 
 
 
315 aa  87.4  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 
272 aa  87  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 
477 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>