More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2164 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02491  protease  68.43 
 
 		 533 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  100 
 
 		 568 aa  1151    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  61.43 
 
 		 566 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  98.56 
 
 		 554 aa  1107    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.91 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  31.82 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 500 aa  188  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  29.2 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  40.56 
 
 		 480 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  31.25 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.66 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  40.37 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  31.23 
 
 		 489 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  29.66 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  30.5 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.86 
 
 		 477 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.1 
 
 		 478 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  30.38 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  27.45 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 		 478 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.62 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  37.05 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  28.47 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  30.05 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  28.28 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  30.31 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 		 487 aa  160  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  34.93 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  35.39 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  30.89 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  35 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  30.27 
 
 		 487 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  35 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 487 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  28.5 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  28.5 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  27.47 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  34.17 
 
 		 487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  34.17 
 
 		 487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  34.17 
 
 		 487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  150  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  26.73 
 
 		 503 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  36.03 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  26.5 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  27.99 
 
 		 478 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.44 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  35.86 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  36.19 
 
 		 553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  27.36 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 567 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.27 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  32.65 
 
 		 481 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 		 588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 		 588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 569 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 593 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.2 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  30.23 
 
 		 411 aa  133  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.2 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.2 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 		 588 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.2 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  34.82 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.2 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.2 
 
 		 589 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.2 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.82 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.79 
 
 		 589 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>