More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0962 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  98.51 
 
 
269 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  98.88 
 
 
269 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  89.22 
 
 
269 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  88.1 
 
 
269 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  87.73 
 
 
269 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  88.1 
 
 
269 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  87.73 
 
 
269 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  86.62 
 
 
269 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  71.32 
 
 
268 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  70.94 
 
 
262 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  69.84 
 
 
266 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  71.03 
 
 
266 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  70.63 
 
 
272 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  71.94 
 
 
266 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  68.25 
 
 
266 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  57.2 
 
 
263 aa  295  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  59.07 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  55.51 
 
 
262 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  54.25 
 
 
265 aa  271  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  53.03 
 
 
268 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  50.2 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  49.38 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  46.62 
 
 
270 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  53.97 
 
 
255 aa  244  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  46.99 
 
 
268 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  47.69 
 
 
271 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  44.53 
 
 
268 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  47.14 
 
 
231 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  42.68 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  42.75 
 
 
271 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  42.86 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  40.31 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  39.06 
 
 
267 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  41.25 
 
 
284 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  37.74 
 
 
265 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  40.09 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  37.16 
 
 
262 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 
259 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  37.04 
 
 
268 aa  169  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  36.58 
 
 
272 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  39.39 
 
 
273 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  46.71 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  39.84 
 
 
258 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.96 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  35.96 
 
 
265 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  39.17 
 
 
247 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  35.69 
 
 
268 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  35.8 
 
 
267 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  39.82 
 
 
280 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  34.63 
 
 
271 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 
320 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  35.25 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  36.4 
 
 
273 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  36.46 
 
 
289 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  40.68 
 
 
272 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  35.25 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  36.22 
 
 
271 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  35.02 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  44.89 
 
 
291 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  34.63 
 
 
274 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  34.66 
 
 
282 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 
267 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  43.75 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  39.32 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
319 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  39.48 
 
 
272 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  39.48 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  37.23 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  39.48 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  37.29 
 
 
273 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 
275 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  42.94 
 
 
284 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  38.16 
 
 
281 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
271 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  36.86 
 
 
273 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  42.94 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  36.36 
 
 
340 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  31.98 
 
 
314 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 
314 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  44.51 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  37.91 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  34.89 
 
 
376 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  37.93 
 
 
284 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  35.83 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
268 aa  125  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
268 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  40.8 
 
 
418 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
316 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
268 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 
404 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>