More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1212 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  100 
 
 
436 aa  876    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  39.9 
 
 
427 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  38.32 
 
 
432 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  37.97 
 
 
424 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  39.9 
 
 
529 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  34.03 
 
 
423 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.71 
 
 
424 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
445 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  34.12 
 
 
453 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  36.18 
 
 
447 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.28 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  40.37 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  40.37 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  46.88 
 
 
489 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  40.65 
 
 
492 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  31.26 
 
 
442 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 
443 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 
489 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  42.58 
 
 
494 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  42.44 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  38.78 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  37.6 
 
 
513 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  39.27 
 
 
478 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  40.97 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  38.84 
 
 
247 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  39.26 
 
 
479 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  34.98 
 
 
268 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.93 
 
 
284 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  37.76 
 
 
490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  37.96 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  36.64 
 
 
264 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  35.94 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  35.94 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  37.19 
 
 
266 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.72 
 
 
479 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.8 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  35.74 
 
 
278 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
286 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.55 
 
 
275 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
271 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  36.43 
 
 
266 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 
292 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.46 
 
 
262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  40.28 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
278 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  36.6 
 
 
266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
480 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  37.17 
 
 
307 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.59 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
270 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  35.24 
 
 
561 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
282 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
470 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 
288 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.95 
 
 
289 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  34.63 
 
 
567 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  34.65 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  34.2 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
269 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  42.62 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
269 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
474 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.59 
 
 
484 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
262 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
269 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
269 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.94 
 
 
392 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
278 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
272 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
263 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  33.08 
 
 
262 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  32.97 
 
 
265 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 
365 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.96 
 
 
605 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 
604 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.1 
 
 
573 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  33.85 
 
 
263 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 
269 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  34.16 
 
 
259 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
275 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 
632 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  34.5 
 
 
315 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  33.88 
 
 
268 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
268 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
269 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  31.87 
 
 
269 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  37.97 
 
 
312 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  39.57 
 
 
474 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6469  peptidase M48 Ste24p  39.88 
 
 
573 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  30.86 
 
 
473 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
269 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
269 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>