More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3623 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  47.79 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.76 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  39.41 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 		 489 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.59 
 
 		 489 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.49 
 
 		 492 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  32.8 
 
 		 436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  30.29 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 		 424 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.66 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.26 
 
 		 513 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.92 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.32 
 
 		 479 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.15 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.41 
 
 		 489 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  34.09 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29.3 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  38.07 
 
 		 493 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 483 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.03 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.9 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 447 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.17 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  31.92 
 
 		 487 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.54 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.23 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  35.36 
 
 		 487 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  35.36 
 
 		 487 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  35.36 
 
 		 487 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  35.36 
 
 		 487 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  35.36 
 
 		 487 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  32.7 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 494 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  30.8 
 
 		 524 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 		 488 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  30.8 
 
 		 494 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.52 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  32.23 
 
 		 487 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  32.44 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.63 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.96 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.62 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  36.61 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.47 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.62 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 		 484 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.75 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 502 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.02 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  33.94 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.44 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 470 aa  99  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  26.61 
 
 		 453 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.52 
 
 		 473 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 486 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 		 593 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.15 
 
 		 589 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.15 
 
 		 589 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.15 
 
 		 560 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.15 
 
 		 572 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.15 
 
 		 572 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.15 
 
 		 572 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.15 
 
 		 589 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.15 
 
 		 588 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  37.35 
 
 		 493 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 		 443 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  36.6 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.15 
 
 		 572 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 564 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>