More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0550 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  79.83 
 
 		 505 aa  776    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  82.4 
 
 		 496 aa  816    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  79.67 
 
 		 497 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 503 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  79.08 
 
 		 488 aa  794    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  78.56 
 
 		 497 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  83.74 
 
 		 497 aa  827    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  58.3 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  46.06 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  45.6 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  44.68 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  42.51 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  44.77 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  44.82 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  43.81 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  44.22 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  44.32 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  43.46 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  43.55 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  42.44 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  40.92 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  42.49 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  41.78 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  42.42 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  41.1 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  38.13 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.85 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29.27 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  30.41 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  35.63 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.06 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.65 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.27 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  28.83 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.64 
 
 		 289 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  36.45 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.89 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.74 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  35.51 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.12 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 289 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 289 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  30.7 
 
 		 424 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 		 278 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 		 282 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 		 484 aa  94  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  36.81 
 
 		 366 aa  93.6  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.48 
 
 		 285 aa  93.2  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 269 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 266 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  32.16 
 
 		 255 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 269 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 269 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 262 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  31.34 
 
 		 275 aa  92.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 		 248 aa  92.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 320 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 		 266 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 268 aa  91.3  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  28.69 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.55 
 
 		 278 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.91 
 
 		 424 aa  90.5  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  32.7 
 
 		 284 aa  90.1  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.72 
 
 		 268 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.99 
 
 		 288 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.76 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 		 268 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  28.1 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  31.73 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  29.32 
 
 		 269 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.47 
 
 		 269 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 269 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 269 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 269 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  29.13 
 
 		 278 aa  87.8  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 263 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  33.65 
 
 		 521 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 266 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 269 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.92 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.05 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.15 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 		 262 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>