More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2220 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
474 aa  951    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  45.84 
 
 
480 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  38.25 
 
 
484 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  40.67 
 
 
500 aa  282  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  37.2 
 
 
473 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
502 aa  254  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
475 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  35.57 
 
 
478 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  35.57 
 
 
478 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  35.57 
 
 
478 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 
478 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  35.75 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  35.06 
 
 
477 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 
477 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
479 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  32.29 
 
 
483 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  35.35 
 
 
518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  36.53 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  35.57 
 
 
477 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  37.44 
 
 
486 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  35.35 
 
 
477 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
564 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
564 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 
566 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 
588 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 
567 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 
588 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 
569 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.89 
 
 
503 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 
487 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 
564 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  30.48 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 
593 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 
588 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  31.5 
 
 
484 aa  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.84 
 
 
561 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  29.23 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  35.41 
 
 
481 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  32.14 
 
 
487 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
483 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  32.14 
 
 
487 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  32.14 
 
 
487 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  32.14 
 
 
487 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  32.14 
 
 
487 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
487 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  33.25 
 
 
487 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.02 
 
 
605 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  34.66 
 
 
488 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  32.99 
 
 
487 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  32.99 
 
 
487 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
487 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  34.08 
 
 
481 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  33.33 
 
 
483 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.53 
 
 
573 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 
494 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.64 
 
 
486 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
489 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  35.58 
 
 
484 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  37.64 
 
 
554 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
489 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
489 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  32.94 
 
 
484 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
489 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
489 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
489 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
489 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  37.47 
 
 
411 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  36.62 
 
 
485 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.34 
 
 
560 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.34 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.44 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.34 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  36.34 
 
 
589 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  36.34 
 
 
589 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.34 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.34 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  36.88 
 
 
568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  41.63 
 
 
524 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  41.63 
 
 
494 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  41.63 
 
 
494 aa  183  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  30.77 
 
 
590 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  31.51 
 
 
561 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  42.35 
 
 
488 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  37.54 
 
 
487 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.12 
 
 
589 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
553 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  40.39 
 
 
487 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
562 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 
487 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 
489 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 
486 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
569 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>