More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5176 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 521 aa  1047    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  52.39 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  51.74 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  51.76 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  55.9 
 
 		 521 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  56.09 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  53.28 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  54.08 
 
 		 514 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  52.65 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  43.76 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 		 553 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35.52 
 
 		 605 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  35.1 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  36.94 
 
 		 573 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  44.81 
 
 		 567 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 		 562 aa  210  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  44.44 
 
 		 569 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 562 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.01 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.01 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 588 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.93 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 		 593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.94 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.75 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  44.4 
 
 		 589 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  45.23 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  45.23 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  45.23 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  41.85 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  45.23 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  45.23 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  45.23 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  45.23 
 
 		 560 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  32.85 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  35.2 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.5 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  31.61 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.06 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 553 aa  156  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.99 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27.74 
 
 		 486 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  34.09 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  29.88 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  39.17 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  38.17 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.43 
 
 		 561 aa  148  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.98 
 
 		 487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  38.63 
 
 		 486 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29.54 
 
 		 487 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.98 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  30.63 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.25 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  30.12 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  28.41 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.76 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.93 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  36.89 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 268 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  29.85 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.64 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.71 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 		 478 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  35.84 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  32.44 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  31.79 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  33.09 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  35.6 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  28.88 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>