More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2068 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
320 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  52.4 
 
 
262 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  57.5 
 
 
284 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  42.11 
 
 
265 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  45.38 
 
 
248 aa  215  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  40.98 
 
 
277 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  40.37 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  38.55 
 
 
275 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  41.57 
 
 
267 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  40.48 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  40.71 
 
 
274 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  39 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
275 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  40.4 
 
 
266 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  40.54 
 
 
263 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  38.97 
 
 
267 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  41.06 
 
 
262 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  43.04 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  45.02 
 
 
272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  38.95 
 
 
270 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  45.02 
 
 
279 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  39.75 
 
 
266 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  39.84 
 
 
269 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 
271 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  38.43 
 
 
270 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  39.61 
 
 
269 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  44.16 
 
 
272 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  38.04 
 
 
268 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  38.78 
 
 
278 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  39.08 
 
 
269 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  39.22 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  40.83 
 
 
269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  39 
 
 
293 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
280 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  39.08 
 
 
269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.6 
 
 
263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  41.33 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  36.72 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  43.8 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  42.68 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
268 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  41.49 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  39.51 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  39.75 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  40.07 
 
 
272 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  34.92 
 
 
270 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 
269 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  37.6 
 
 
265 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 
269 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 
269 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  42.42 
 
 
282 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 
298 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
270 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  37.4 
 
 
269 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  41.99 
 
 
273 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.55 
 
 
270 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  42.42 
 
 
272 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  41.74 
 
 
273 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  40.52 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  37.09 
 
 
289 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  38.52 
 
 
266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.3 
 
 
274 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  36.86 
 
 
268 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  35.63 
 
 
272 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  38.58 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  37.77 
 
 
247 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  37.18 
 
 
273 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  36.26 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  35.69 
 
 
376 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  35.52 
 
 
268 aa  143  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  36.76 
 
 
478 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  37.2 
 
 
268 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  33.08 
 
 
254 aa  139  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  40.84 
 
 
231 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  35.32 
 
 
278 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.7 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  37.01 
 
 
268 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  38.54 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.44 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  35.66 
 
 
479 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
427 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
278 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.86 
 
 
513 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  37.98 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  41.01 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
489 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  38.65 
 
 
284 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.62 
 
 
264 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  37.91 
 
 
280 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  38.01 
 
 
489 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  35.32 
 
 
366 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  39.55 
 
 
489 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>