More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0012 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  55.6 
 
 
262 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  57.5 
 
 
320 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  47.22 
 
 
248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  43.68 
 
 
277 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  41.41 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 
265 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  43.63 
 
 
269 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  41.18 
 
 
267 aa  204  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  40.54 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  39.08 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  38.52 
 
 
275 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  41.43 
 
 
271 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  41.43 
 
 
268 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  39.18 
 
 
275 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  41.77 
 
 
278 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  41.35 
 
 
270 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  41.39 
 
 
269 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  41.39 
 
 
269 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  40.98 
 
 
269 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  40.16 
 
 
269 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  38.13 
 
 
266 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  43.51 
 
 
264 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  39.6 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  38.06 
 
 
267 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  40.4 
 
 
268 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  38.34 
 
 
263 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
272 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  38.17 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  38.84 
 
 
262 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
269 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  40.17 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  39.59 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
269 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 
269 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  40.91 
 
 
266 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  37.76 
 
 
263 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  41.95 
 
 
255 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  38.59 
 
 
270 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  36.93 
 
 
266 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  39 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  38.93 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 
271 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.76 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  39.22 
 
 
247 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  39.57 
 
 
266 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  39.69 
 
 
268 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  40.09 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  40.89 
 
 
259 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  36.29 
 
 
267 aa  156  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  35.74 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  40 
 
 
273 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  37.76 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  35.69 
 
 
282 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.9 
 
 
271 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  39.37 
 
 
298 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  35.04 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  35.04 
 
 
272 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  39.92 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  40.48 
 
 
272 aa  152  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  38.79 
 
 
280 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.88 
 
 
271 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  38.08 
 
 
289 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36 
 
 
274 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  42.77 
 
 
231 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
271 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  31.78 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  35.47 
 
 
376 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  40.65 
 
 
268 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
478 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  36.14 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  37.14 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.52 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  38.66 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  38.66 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  37.96 
 
 
489 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 
268 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.68 
 
 
513 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  34.38 
 
 
479 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  37.88 
 
 
319 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36.32 
 
 
489 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
489 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  35.85 
 
 
366 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 
305 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  39.89 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.33 
 
 
479 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  42.2 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  37.86 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
278 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.6 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>