More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0006 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  77.61 
 
 
268 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  66.29 
 
 
271 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  66.29 
 
 
271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  49.8 
 
 
293 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  47.78 
 
 
262 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  48.62 
 
 
263 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  44.71 
 
 
268 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  47.74 
 
 
271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  47.64 
 
 
266 aa  224  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  49.41 
 
 
255 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  46.27 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  44.69 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  43.87 
 
 
265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  44.57 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  45 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  45.26 
 
 
269 aa  218  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  45.26 
 
 
269 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  45.19 
 
 
262 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  45.32 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  45.26 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  45.2 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  45.81 
 
 
231 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  44.69 
 
 
269 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  44.94 
 
 
266 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  41.15 
 
 
270 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  46.31 
 
 
269 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  46.31 
 
 
269 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  45.9 
 
 
269 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  45 
 
 
268 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  45.49 
 
 
269 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  44.44 
 
 
264 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  37.82 
 
 
270 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  41.29 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  39 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  38.62 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  42.53 
 
 
247 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  39.27 
 
 
270 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  38.21 
 
 
280 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  40.17 
 
 
259 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  35.25 
 
 
272 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  36.88 
 
 
258 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  34.7 
 
 
270 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  36.47 
 
 
267 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  35.85 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  35.13 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  35.82 
 
 
265 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  36.64 
 
 
269 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  34.93 
 
 
274 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  41.44 
 
 
284 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  33.58 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  33.46 
 
 
267 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  36.19 
 
 
275 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  34.2 
 
 
272 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
271 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  34.24 
 
 
274 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
271 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  37.93 
 
 
376 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  37.39 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  36.59 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  32.73 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  34.06 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  36.54 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  34.85 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  36.59 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.84 
 
 
268 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.84 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  32.96 
 
 
273 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  36.98 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  36.43 
 
 
285 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  41.01 
 
 
267 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
316 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  39.11 
 
 
271 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  42.71 
 
 
418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  36 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 
489 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  36.52 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 
305 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  37.64 
 
 
291 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 
489 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  34.85 
 
 
432 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.89 
 
 
489 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  31.28 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
494 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  34.4 
 
 
474 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 
288 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  37.7 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 
504 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
483 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>