More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3278 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  63.81 
 
 
277 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  61.66 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  55.19 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  53.31 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  53.17 
 
 
274 aa  293  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  52.44 
 
 
269 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  54.55 
 
 
275 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  54.15 
 
 
265 aa  284  9e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  50.19 
 
 
271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  45.98 
 
 
248 aa  234  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  42.91 
 
 
262 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  41.15 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
320 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  41.15 
 
 
262 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  41.73 
 
 
265 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  39.84 
 
 
284 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  40.65 
 
 
263 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  40.7 
 
 
268 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  37.79 
 
 
262 aa  184  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  36.74 
 
 
268 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  41.2 
 
 
293 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  42.21 
 
 
264 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  39.62 
 
 
269 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  40.74 
 
 
263 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 
270 aa  176  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  40.25 
 
 
255 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  37.74 
 
 
269 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  37.08 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  40.08 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  38.43 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  40.08 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  37.74 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  36.58 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  35.02 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  38.02 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  39.6 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  38.25 
 
 
266 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  39.39 
 
 
259 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  42.42 
 
 
298 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  38 
 
 
266 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  36.26 
 
 
267 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  40.71 
 
 
271 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  37.7 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  37.87 
 
 
274 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  37.13 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  34.35 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  39.37 
 
 
272 aa  161  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  38.49 
 
 
280 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 
289 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  36.44 
 
 
278 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 
268 aa  156  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
266 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  35.54 
 
 
247 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  43.02 
 
 
231 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  36.09 
 
 
273 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  39.52 
 
 
273 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  36.86 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  39.11 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.25 
 
 
270 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  35.96 
 
 
273 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 
291 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  34.8 
 
 
311 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 
271 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  37.4 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  30.18 
 
 
268 aa  138  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  34.82 
 
 
319 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  34.59 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  35.6 
 
 
376 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  32.86 
 
 
271 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34.96 
 
 
268 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  32.48 
 
 
279 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
285 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
305 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
288 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  35.2 
 
 
284 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  41.57 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 
418 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  35.12 
 
 
302 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  34.27 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  35.54 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  37.95 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  32 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  37.08 
 
 
314 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  41.57 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
284 aa  118  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  36.16 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.77 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.62 
 
 
427 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>