More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1238 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  72.83 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  56.06 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  57.09 
 
 		 268 aa  328  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  36.82 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  38.03 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  39.75 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 479 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  36.03 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.45 
 
 		 502 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  34.52 
 
 		 605 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 		 481 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 		 484 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.69 
 
 		 483 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 		 474 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  38.91 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  39.34 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  38.91 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.89 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.99 
 
 		 573 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  33.63 
 
 		 486 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 		 500 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.99 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  36.97 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.75 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  34.16 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  34.12 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  34.82 
 
 		 487 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 		 424 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 486 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 		 480 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 		 494 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 		 485 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 489 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.04 
 
 		 487 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.47 
 
 		 518 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  35.44 
 
 		 489 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  31.93 
 
 		 483 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 632 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 		 549 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 		 489 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 481 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  32.39 
 
 		 484 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.76 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 483 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  34.16 
 
 		 475 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 632 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  31.5 
 
 		 486 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.93 
 
 		 513 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 		 487 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 490 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  33.88 
 
 		 453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 		 562 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  35.74 
 
 		 436 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 489 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29 
 
 		 487 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 469 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  33.76 
 
 		 445 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 		 565 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  34.87 
 
 		 490 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  33.05 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 		 541 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.67 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.67 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.67 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.67 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.28 
 
 		 533 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.67 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  31.05 
 
 		 485 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 489 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 489 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 489 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.34 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  30.61 
 
 		 489 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>