More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3748 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 423 aa  863    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  51.6 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  39.76 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  45.29 
 
 		 529 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  42.12 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.03 
 
 		 436 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 		 445 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  32.23 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  39.26 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  38.63 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 		 278 aa  140  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  39.25 
 
 		 489 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 		 248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  39.07 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 		 494 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  36.18 
 
 		 272 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  37.7 
 
 		 284 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  37.17 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.8 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  35.89 
 
 		 478 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  35.55 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  38.4 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  34.68 
 
 		 268 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  36.44 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  36.07 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  34.52 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35.82 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 269 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  34.66 
 
 		 269 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 269 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 269 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  34.66 
 
 		 269 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  31.56 
 
 		 267 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 		 266 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  34.26 
 
 		 269 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  36.25 
 
 		 268 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  33.59 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  32.8 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.89 
 
 		 264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  34.94 
 
 		 269 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  31.91 
 
 		 265 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.66 
 
 		 262 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 268 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  35.83 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 268 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  30.71 
 
 		 277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  39.63 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  34.18 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  33.47 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.64 
 
 		 270 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.52 
 
 		 265 aa  109  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 		 267 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  31.28 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  36.61 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.94 
 
 		 285 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  30.83 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 		 274 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 		 513 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27.81 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 289 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  31.45 
 
 		 285 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  29.92 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  33.75 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  32.85 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>