More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2749 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
494 aa  981    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  38.65 
 
 
492 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  37.81 
 
 
489 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36.83 
 
 
489 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  36.83 
 
 
493 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.62 
 
 
489 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.27 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.16 
 
 
493 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  36.27 
 
 
513 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.86 
 
 
490 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.31 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.18 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  35.35 
 
 
513 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  38.36 
 
 
479 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  39.46 
 
 
442 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  42.58 
 
 
436 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.45 
 
 
479 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  32.29 
 
 
520 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
445 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  34.1 
 
 
493 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  35.14 
 
 
503 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  34.54 
 
 
505 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 
524 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
268 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  43.95 
 
 
529 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 
453 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  32.76 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  37.55 
 
 
423 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
480 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  39.57 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
268 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
496 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.8 
 
 
284 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  38.15 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  28.63 
 
 
493 aa  134  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  38.69 
 
 
432 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  31.71 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 
516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  35.33 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  37.12 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  35.05 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  32.85 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  37.56 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
268 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  37.83 
 
 
470 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
266 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  36.53 
 
 
427 aa  127  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  39.41 
 
 
424 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  28.53 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.03 
 
 
484 aa  126  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  34.86 
 
 
482 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  33.45 
 
 
480 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  28.84 
 
 
476 aa  123  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  34.96 
 
 
513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.7 
 
 
264 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  38.43 
 
 
286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
292 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
266 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  31.43 
 
 
272 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
481 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  36.45 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  37.39 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.63 
 
 
473 aa  114  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 
490 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  34.51 
 
 
266 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  33.76 
 
 
247 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.98 
 
 
282 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 
266 aa  113  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  36.87 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
269 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  30.5 
 
 
265 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
483 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 
269 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.89 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 
263 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 
269 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  32.06 
 
 
258 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  33.83 
 
 
485 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
268 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  29.85 
 
 
248 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  31.68 
 
 
262 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
548 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>