More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0844 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
470 aa  956    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  48.04 
 
 
490 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  41.77 
 
 
472 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  46.63 
 
 
481 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  41.15 
 
 
483 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  41.07 
 
 
469 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
474 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 
480 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.74 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
605 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  25.99 
 
 
494 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  37.07 
 
 
533 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  26.92 
 
 
485 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  26.39 
 
 
489 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  26.62 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  32.65 
 
 
478 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.15 
 
 
478 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.43 
 
 
503 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.15 
 
 
478 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.03 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  26.62 
 
 
489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  26.7 
 
 
489 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
475 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 
392 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  26.68 
 
 
485 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.82 
 
 
502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  25.78 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 
553 aa  136  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  26.77 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  27.75 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
500 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 
569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 
484 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.61 
 
 
486 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.3 
 
 
494 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  29.37 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  25.53 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 
268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  37.61 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  37.21 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  29.69 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  36.16 
 
 
477 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  43.64 
 
 
573 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.39 
 
 
483 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.97 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.8 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.88 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.8 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.8 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  36.8 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.8 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.8 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.8 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  36.8 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  36.12 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 
487 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 
566 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
488 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 
548 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.54 
 
 
365 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  29.6 
 
 
487 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  32.79 
 
 
518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  29.71 
 
 
477 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  34.35 
 
 
477 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  29.96 
 
 
561 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  27.83 
 
 
486 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 
481 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  27.12 
 
 
488 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
554 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 
268 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
553 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  31.6 
 
 
533 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 
521 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  37.77 
 
 
564 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.64 
 
 
564 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  27.79 
 
 
481 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 
588 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  27.34 
 
 
489 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 
588 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  34.77 
 
 
477 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.62 
 
 
487 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
562 aa  123  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  35.5 
 
 
590 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  31.96 
 
 
487 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  31.96 
 
 
487 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>