More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1841 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  77.94 
 
 
489 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  76.49 
 
 
489 aa  759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  77.18 
 
 
485 aa  764    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  81.03 
 
 
486 aa  817    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  76.29 
 
 
486 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  81.86 
 
 
486 aa  792    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  77.94 
 
 
489 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  77.94 
 
 
489 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
485 aa  986    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  71.13 
 
 
490 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  77.94 
 
 
489 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  76.15 
 
 
489 aa  727    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  77.94 
 
 
489 aa  778    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  77.32 
 
 
489 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  77.32 
 
 
489 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  73.49 
 
 
489 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  48.03 
 
 
487 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  50.1 
 
 
488 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  46.06 
 
 
484 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  46.54 
 
 
481 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  46.51 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  42.98 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  46.09 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  45.93 
 
 
487 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  45.72 
 
 
487 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  45.93 
 
 
487 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  46.55 
 
 
484 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  45.72 
 
 
487 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  45.72 
 
 
487 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  45.09 
 
 
487 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  45.09 
 
 
487 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  45.3 
 
 
487 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  44.8 
 
 
487 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  44.59 
 
 
487 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  42.74 
 
 
487 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  44.87 
 
 
488 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  43.78 
 
 
524 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  43.78 
 
 
494 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  43.56 
 
 
494 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  44.62 
 
 
487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  44.64 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  38.3 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.56 
 
 
503 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 
478 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 
478 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  34.68 
 
 
478 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  35.32 
 
 
478 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  37.92 
 
 
479 aa  246  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.4 
 
 
502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  32.6 
 
 
473 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  34.12 
 
 
475 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  34.72 
 
 
477 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 
477 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.41 
 
 
483 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  34.28 
 
 
477 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  34.04 
 
 
477 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  33.83 
 
 
477 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  34.42 
 
 
477 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.37 
 
 
500 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  33.88 
 
 
478 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  36.85 
 
 
490 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  33.88 
 
 
478 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 
605 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  34.05 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.7 
 
 
518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 
480 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.44 
 
 
561 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
565 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 
569 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.54 
 
 
562 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 
567 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.79 
 
 
474 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.42 
 
 
573 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  38.91 
 
 
494 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  33.59 
 
 
411 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 
562 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  27.1 
 
 
566 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  28.01 
 
 
533 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  40.5 
 
 
533 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  36.64 
 
 
568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  28.83 
 
 
590 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 
481 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.27 
 
 
560 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.74 
 
 
589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.27 
 
 
589 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.27 
 
 
589 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 
569 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 
533 aa  156  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  35.52 
 
 
588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>