More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3882 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
340 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  37.79 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
270 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  36.07 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.82 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
445 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
489 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 
292 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
489 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 
489 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 
286 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 
489 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33.33 
 
 
436 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 
493 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 
292 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 
604 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 
484 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.56 
 
 
513 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  32.06 
 
 
474 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30.62 
 
 
453 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.75 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 
632 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.32 
 
 
445 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.92 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 
632 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  26.67 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 
480 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.66 
 
 
479 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  26.94 
 
 
490 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.7 
 
 
479 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
504 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
268 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 
365 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.36 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 
284 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
424 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.2 
 
 
473 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 
480 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.4 
 
 
478 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
268 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.36 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  30.29 
 
 
640 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.4 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
493 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 
470 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  32.38 
 
 
469 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  34.01 
 
 
424 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.64 
 
 
289 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 
479 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  29.6 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 
280 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  29.86 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5407  peptidase M48 Ste24p  31.44 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.94 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.42 
 
 
569 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.54 
 
 
561 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  28.91 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  30.41 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
474 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 
528 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  26.72 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  30.33 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  27.78 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.12 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
567 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  28.27 
 
 
573 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.49 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  26.88 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  28.46 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.58 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.46 
 
 
487 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
493 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  30.45 
 
 
500 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  25.62 
 
 
605 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30.34 
 
 
548 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.59 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  30.58 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.15 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>