More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0552 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  79.39 
 
 		 496 aa  793    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 497 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  86.23 
 
 		 505 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  78.95 
 
 		 503 aa  798    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  93.56 
 
 		 497 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  82.34 
 
 		 497 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  77.43 
 
 		 488 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  56.9 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  43.81 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  44.65 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  45.29 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  43.36 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  45.41 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  41.67 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  45.41 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  42.77 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  45.64 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  42.21 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  40.04 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  42.48 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  40.66 
 
 		 513 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  39.92 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  40.25 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  43.11 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  39.36 
 
 		 504 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  38.74 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  33.4 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.13 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.69 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.83 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.1 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.76 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.11 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  24.7 
 
 		 493 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  26.64 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 		 494 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.18 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.73 
 
 		 289 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  31.53 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.48 
 
 		 266 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 		 278 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  34.33 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  34.33 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  36.26 
 
 		 366 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 		 289 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  34.33 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  34.33 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  34.33 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.76 
 
 		 288 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.53 
 
 		 473 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  35.52 
 
 		 286 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.4 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 		 289 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.4 
 
 		 529 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 269 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 269 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30.8 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  32.97 
 
 		 285 aa  90.5  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 269 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  32.34 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.86 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.86 
 
 		 268 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.63 
 
 		 268 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 		 282 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 		 278 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 262 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.44 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 		 284 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 248 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  31.84 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  34.2 
 
 		 560 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 		 266 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  34.2 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  34.2 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  34.2 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  34.2 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  34.2 
 
 		 589 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 		 442 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>