More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2092 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  37.55 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.44 
 
 
278 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
268 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 
268 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  35.54 
 
 
392 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  37.61 
 
 
289 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  38.12 
 
 
484 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.29 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  38.01 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  35.08 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  37.39 
 
 
500 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  35.66 
 
 
513 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
365 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
424 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 
474 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  35.51 
 
 
469 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  40.82 
 
 
427 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
483 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  36.56 
 
 
284 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 
445 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
502 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 
487 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 
483 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  37.13 
 
 
488 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 
481 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 
475 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
445 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 
492 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 
486 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
480 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 
604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  35.12 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.56 
 
 
490 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
442 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.47 
 
 
605 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  32.23 
 
 
490 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  37.5 
 
 
436 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.95 
 
 
479 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 
489 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.84 
 
 
473 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  31.72 
 
 
483 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  34.65 
 
 
489 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.68 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  31.12 
 
 
632 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 
569 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
453 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
478 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  31.12 
 
 
632 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
521 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.13 
 
 
487 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.13 
 
 
487 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.13 
 
 
487 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.13 
 
 
487 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.13 
 
 
487 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  34.16 
 
 
489 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 
487 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  28.26 
 
 
487 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 
567 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  28.26 
 
 
487 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.33 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  34.51 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  28.26 
 
 
487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 
470 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.17 
 
 
480 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  27.83 
 
 
487 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.61 
 
 
561 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
504 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 
553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.54 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.05 
 
 
533 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.57 
 
 
265 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.31 
 
 
294 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  31.74 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
487 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 
485 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 
497 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
474 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
487 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 
490 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 
550 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
514 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
481 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  32.46 
 
 
548 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 
485 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>