More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1362 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 516 aa  1035    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  60.94 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  46.79 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  45.1 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  42.61 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  45.61 
 
 		 478 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  44.47 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  42.32 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  41.55 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  45.93 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  43.07 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  44.97 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  42.77 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  44.97 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  42.41 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  42.32 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  43.44 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  42.11 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  41.05 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  39.18 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  39.2 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  38.7 
 
 		 513 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  38.74 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  38.32 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  37.87 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 513 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.31 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29.89 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.7 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  27.25 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.4 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  27.84 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  26.71 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  28.04 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  28.6 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  26.76 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  31.39 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25.11 
 
 		 479 aa  124  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.88 
 
 		 284 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.33 
 
 		 285 aa  97.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  27.4 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.52 
 
 		 445 aa  93.6  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 278 aa  93.6  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 		 279 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 		 279 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 		 278 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  28.42 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  28.42 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 269 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  28.08 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  28.08 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 269 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  28.08 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 269 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 272 aa  91.3  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  25 
 
 		 561 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  27.72 
 
 		 266 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 		 484 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 427 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 		 488 aa  90.1  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  28.57 
 
 		 436 aa  90.1  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.9 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  27.27 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.96 
 
 		 280 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.42 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  28.37 
 
 		 288 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  30.97 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 553 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  30.97 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 		 269 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 269 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  26.82 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 269 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 		 286 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 269 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.16 
 
 		 293 aa  87  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 		 554 aa  87  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  26.82 
 
 		 487 aa  87  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 		 266 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>