More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1904 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
493 aa  996    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  61.85 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  47.86 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  41.52 
 
 
504 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  32.67 
 
 
475 aa  240  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  32.46 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
476 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
520 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
503 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  35.01 
 
 
513 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  33.84 
 
 
482 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  31.57 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 
497 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 
516 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
503 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  33.26 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  34.77 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  32.06 
 
 
514 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  31.58 
 
 
488 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
487 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
500 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  34.07 
 
 
524 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  33.55 
 
 
497 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
497 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 
489 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33 
 
 
493 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  29.98 
 
 
492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.4 
 
 
494 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
494 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  30.45 
 
 
471 aa  189  9e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.42 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.92 
 
 
513 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  30.89 
 
 
479 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  33.26 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 
489 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.49 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
489 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.06 
 
 
479 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.15 
 
 
284 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 
424 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  40.28 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  37.62 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  38.84 
 
 
292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  37.84 
 
 
292 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  34.57 
 
 
442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  39.79 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  35.59 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
445 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  37.77 
 
 
392 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.97 
 
 
473 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34.69 
 
 
268 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 
487 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  35 
 
 
264 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 
268 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  35.15 
 
 
487 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
432 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
307 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 
524 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  34.67 
 
 
494 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  34.67 
 
 
494 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 
487 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 
281 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  36.95 
 
 
284 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 
268 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.5 
 
 
477 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  33.5 
 
 
280 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.55 
 
 
262 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
478 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  37.37 
 
 
572 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.94 
 
 
262 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  37.37 
 
 
572 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  37.37 
 
 
572 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  37.37 
 
 
572 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  37.37 
 
 
589 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  37.37 
 
 
560 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  37.37 
 
 
589 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  37.69 
 
 
259 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  31.88 
 
 
427 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
478 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 
569 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
478 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
271 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 
488 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 
474 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.06 
 
 
529 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  31.89 
 
 
265 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.84 
 
 
589 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  35.64 
 
 
590 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
365 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  32.58 
 
 
477 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  35.08 
 
 
270 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
481 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>