More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4877 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
492 aa  1021    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  59.37 
 
 
489 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  38.84 
 
 
494 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  39.79 
 
 
493 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  38.48 
 
 
489 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  37.44 
 
 
489 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.45 
 
 
490 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  37.92 
 
 
513 aa  229  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.86 
 
 
504 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.87 
 
 
493 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  33.42 
 
 
478 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  34.6 
 
 
479 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.01 
 
 
479 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  28.75 
 
 
513 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  28.82 
 
 
520 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29 
 
 
479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  39.42 
 
 
445 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  28.6 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  28.34 
 
 
475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  28.48 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  28.29 
 
 
496 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  26.71 
 
 
516 aa  162  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 
503 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 
476 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  40.65 
 
 
436 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  39.47 
 
 
443 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
424 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
505 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
497 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
427 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  28.26 
 
 
488 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  35.82 
 
 
487 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
447 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  35.82 
 
 
500 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  35.45 
 
 
524 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  31.74 
 
 
493 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 
503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  35.74 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
284 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  27.65 
 
 
471 aa  147  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 
494 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
513 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  34.26 
 
 
442 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
482 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.77 
 
 
479 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 
514 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  27.55 
 
 
513 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.71 
 
 
262 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  34.19 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  36.65 
 
 
529 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  35.77 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  35.55 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.49 
 
 
294 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  34.56 
 
 
445 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
248 aa  125  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.2 
 
 
264 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.24 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 
485 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
489 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
489 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
489 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
489 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 
278 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 
280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
292 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 
270 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.34 
 
 
285 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28.86 
 
 
278 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.58 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.93 
 
 
483 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 
268 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
474 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 
307 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
490 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.91 
 
 
484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.64 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  32.86 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 
268 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 
284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  28.89 
 
 
284 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 
278 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>