More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1448 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 469 aa  971    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  49.16 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  50.11 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  40.99 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  39.08 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  29.2 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  39.48 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.02 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  27.05 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  29.93 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  30.39 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  29.93 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  29.93 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  30.43 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.61 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  30.36 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 		 280 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.3 
 
 		 264 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  27.87 
 
 		 605 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  26.86 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.96 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 		 392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  28.07 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.35 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  37.66 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  28.86 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  26.93 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.69 
 
 		 483 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 		 489 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.74 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.86 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.9 
 
 		 569 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.62 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  28.61 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  28.61 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  28.61 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  27.92 
 
 		 566 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  38.26 
 
 		 278 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  36.89 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.36 
 
 		 567 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.6 
 
 		 533 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  29.74 
 
 		 477 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 		 487 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  35.08 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  27.31 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  27.61 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  34.91 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  31.46 
 
 		 518 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  35.36 
 
 		 282 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  27.13 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  27.61 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  35.65 
 
 		 265 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.27 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  27.13 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.27 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.27 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.62 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.63 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  32.91 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.41 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  27.2 
 
 		 553 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  28.47 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 		 553 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.47 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  24.46 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  28.95 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  33.47 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>