More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2967 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
453 aa  936    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  44.37 
 
 
447 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  46.06 
 
 
442 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  43.52 
 
 
445 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  48.51 
 
 
443 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  45.21 
 
 
445 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  38.44 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  37.71 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.12 
 
 
436 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.69 
 
 
432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  31.22 
 
 
424 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
489 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  38.6 
 
 
489 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  38.6 
 
 
489 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
424 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.92 
 
 
423 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.72 
 
 
479 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.85 
 
 
513 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 
478 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  39.21 
 
 
529 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.25 
 
 
490 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
504 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
494 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.61 
 
 
479 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  35.24 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
278 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.06 
 
 
275 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.92 
 
 
262 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
479 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 
268 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  26.71 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  24.8 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
280 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.52 
 
 
264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  33.16 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.36 
 
 
479 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  25.54 
 
 
479 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 
278 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.01 
 
 
480 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
270 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  32.44 
 
 
247 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
286 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  25.65 
 
 
469 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.25 
 
 
470 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 
275 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  25.88 
 
 
265 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  27.25 
 
 
490 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.32 
 
 
293 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 
320 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.68 
 
 
282 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  23.66 
 
 
474 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  27.82 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.68 
 
 
265 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
340 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  29.84 
 
 
292 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.42 
 
 
487 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  27.67 
 
 
269 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
278 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  26.61 
 
 
294 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  26.1 
 
 
284 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.59 
 
 
502 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 
292 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.08 
 
 
262 aa  97.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 
604 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  28.28 
 
 
288 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.67 
 
 
285 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  28.81 
 
 
573 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  27.91 
 
 
248 aa  94  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  26.48 
 
 
265 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  26.56 
 
 
279 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  26.56 
 
 
279 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  27.09 
 
 
351 aa  93.2  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.08 
 
 
632 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  28.35 
 
 
481 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.08 
 
 
632 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  25.31 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  27.6 
 
 
494 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  25.14 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  27.6 
 
 
494 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  25 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 
524 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 
605 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0556  peptidase M48 Ste24p  31.6 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
528 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 
550 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 
267 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  27.08 
 
 
271 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
640 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 
513 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 
271 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 
486 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>