More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4269 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  78.01 
 
 		 503 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  80.42 
 
 		 513 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1054    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  80 
 
 		 482 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  59.58 
 
 		 493 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  60.38 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  59.41 
 
 		 476 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  45.36 
 
 		 471 aa  425  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  43.74 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  43.55 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  41.82 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  42.59 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  44.07 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  41.79 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  42.66 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  42.65 
 
 		 497 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  41.67 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  37.08 
 
 		 504 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  38.54 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 		 493 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  36.83 
 
 		 514 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  40.04 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  38.68 
 
 		 494 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  36.23 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.01 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.57 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  28.48 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 489 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.54 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  26.79 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  26.1 
 
 		 478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.07 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 		 489 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  31.46 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  24.72 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.96 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  35.98 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 554 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 269 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 		 278 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 		 280 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  30.89 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 284 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.36 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 268 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 		 282 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.64 
 
 		 264 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 442 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.05 
 
 		 266 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.96 
 
 		 266 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  38.56 
 
 		 270 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 		 268 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 		 278 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 		 266 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  32.65 
 
 		 477 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 566 aa  94  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 286 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.49 
 
 		 529 aa  93.6  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.16 
 
 		 269 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 		 268 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  32.35 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.37 
 
 		 265 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 262 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  31.64 
 
 		 255 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 263 aa  91.3  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 		 248 aa  90.9  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  29.09 
 
 		 288 aa  90.9  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.57 
 
 		 285 aa  90.5  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.26 
 
 		 289 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  31.22 
 
 		 315 aa  90.1  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.98 
 
 		 320 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30.46 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 272 aa  89.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  30.7 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 		 266 aa  89.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.39 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.39 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 268 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>