More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1887 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
315 aa  627  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  39.41 
 
 
294 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  38.76 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.9 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  37.79 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  39.29 
 
 
479 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  36.96 
 
 
292 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.76 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  36.56 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  38.42 
 
 
513 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.65 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.92 
 
 
285 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.5 
 
 
436 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  33.78 
 
 
307 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  34.01 
 
 
479 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  34.01 
 
 
479 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.05 
 
 
490 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.65 
 
 
264 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.6 
 
 
478 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 
424 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 
447 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 
286 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 
481 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  38.04 
 
 
493 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 
524 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
487 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
478 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
500 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  29.46 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 
427 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.9 
 
 
504 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 
484 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  30.62 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
489 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 
502 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
489 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
489 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
424 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.64 
 
 
489 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 
492 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  30.09 
 
 
262 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
483 aa  92.8  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.32 
 
 
488 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
268 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 
474 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 
487 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.36 
 
 
432 aa  92.4  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.79 
 
 
487 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 
445 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  30.81 
 
 
473 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.2 
 
 
493 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 
554 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 
476 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.42 
 
 
480 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  34.24 
 
 
568 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.07 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  31.22 
 
 
513 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
505 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 
500 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.73 
 
 
475 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.44 
 
 
494 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.44 
 
 
494 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 
497 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
494 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.44 
 
 
524 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.98 
 
 
479 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 
567 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
503 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  36.22 
 
 
573 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  35.33 
 
 
520 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
513 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
482 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 
494 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 
480 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.73 
 
 
561 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  33.71 
 
 
488 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 
481 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  30.96 
 
 
480 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  29.66 
 
 
351 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 
632 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 
569 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  29.06 
 
 
632 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 
470 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 
284 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  31.58 
 
 
471 aa  86.7  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  37.99 
 
 
569 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  28.57 
 
 
487 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
497 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 
489 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>